Nach einem Zusammenstoß mit dem Kopfgeldjäger Sylux kommt es zu einer Explosion, die Samus auf den Planeten Viewros verschlägt. Die dicht bewachsenen, uralten Dschungel dieses Himmelskörpers dienen einem außerirdischen Volk namens Lamorn als Heimat. Diese Gemeinschaft stellt Samus vor eine besondere Aufgabe und gewährt ihr dafür neuartige Psy-Fähigkeiten. Mithilfe dieser Kräfte kann sie etwa Mechanismen aktivieren, die Flugbahn geladener Schüsse modifizieren und Bereiche betreten, die zuvor nicht erreichbar waren.

Auf Viewros muss Samus komplexe, verschlungene Regionen durchqueren und sich gegen zahlreiche feindliche Kreaturen behaupten. Die stetige Verbesserung ihres Fertigkeitenrepertoires bildet dabei einen wesentlichen Bestandteil des Fortschritts. Darüber hinaus wurden mehrere Einheiten der Galaktischen Föderation ebenfalls auf den Planeten transportiert. Diese unterstützen Samus beim Versuch, einen Weg zurückzufinden.

Im Verlauf des Abenteuers erhält Samus außerdem ein Fahrzeug namens Vi-O-La. Diese Maschine wurde für schnelle Fortbewegung und den Kampf gegen gegnerische Lebensformen konzipiert und verfügt über eigene Waffensysteme, die das Arsenal der Heldin erweitern.

Die Version „Metroid Prime 4: Beyond – Nintendo Switch 2 Edition“ bietet zusätzliche technische Funktionen. Dazu gehört ein Maus-Modus, bei dem die Joy-Con-2-Controller wie eine Computermaus genutzt werden können, um präzise Bewegungen zu ermöglichen. Zudem werden höhere Auflösungen, schnellere Bildfrequenzen und HDR-Unterstützung bereitgestellt.

Nutzer können zwischen zwei Darstellungsvarianten wählen: Der Qualitätsmodus ermöglicht im TV-Betrieb Auflösungen von bis zu 4K und im Handheld-Modus 1080p bei konstanten 60 Bildern pro Sekunde. Der Leistungsmodus setzt auf Bildraten von bis zu 120 fps bei einer Auflösung von maximal 1080p (TV-Modus) beziehungsweise 720p (Handheld-Modus).

Parallel zur Veröffentlichung erscheinen heute neue amiibo-Figuren. Die Figur Sylux („Metroid Prime 4: Beyond“) ist ab sofort erhältlich. Zwei weitere Modelle – Samus („Metroid Prime 4: Beyond“) sowie Samus & Vi-O-La („Metroid Prime 4: Beyond“) – sind bereits seit dem 6. November im Handel und im My Nintendo Store verfügbar.